КЛАССИФИКАЦИЯ САМООРГАНИЗУЮЩИХСЯ ПЕПТИДОВ

© 2011 г. А. В. Данилкович*^,**^#, В. М. Липкин**^,***, И. П. Удовиченко*^,**

^#Тел: (4967) 73-08-93; факс: (4967) 33-05-27; e-mail: danilkovich@fibkh.serpuhkov.su

*Филиал Учреждения Российской академии наук Институт биоорганической химии им. академиков М.М.Шемякина и Ю.А.Овчинникова РАН, Московская область, Пущино, 142290;

**Пущинский государственный университет, МО., Пущино, просп. Науки-3, 142290;

***Учреждение Российской академии наук Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН Москва

Поступила в редакцию 28.04 2011 г. Принята к печати 16.06.2011 г.

Систематическое обобщение данных о структуре природных и синтетических самоорганизующихся полипептидов позволило унифицировать способ классификации последовательностей аминокислотных остатков, содержащих регулярно повторяющиеся мотивы, обеспечивающие взаимодействие молекул в процессе самосборки и формирования надмолекулярных комплексов. Продемонстрированы преимущества предложенной системы классификации по сравнению с ранними попытками упорядочения структурной информации о самоорганизующихся пептидах. Предложена схема анализа повторяющихся мотивов самоорганизующихся пептидов и разработана унифицированная система их классификации.

Ключевые слова: пептиды, самоорганизующиеся, система классификации; пептиды, фибрилообразующие; биоматрикс; амилоид.

Биоорг.химия 2011, 37 (6): 780-785