Обзорная статья

РАСЧЕТНЫЕ МЕТОДЫ КОНФОРМАЦИОННОГО АНАЛИЗА УГЛЕВОДОВ

© 2007 г. А. Г. Гербст, А. А. Грачев, А. С. Шашков, Н. Э. Нифантьев^#

^#Тел./факс: (495) 135-87-84; e-mail: nen@ioc.ac.ru

Институт органической химии им. Н.Д. Зелинского РАН, 119991, Москва, В-334, Ленинский просп., 47

Поступила в редакцию 04.09.2006 г. Принята к печати 07.09.2006 г.

Все большее число работ в современных исследованиях углеводов посвящается изучению пространственных механизмов их участия в процессах клеточного узнавания и направленному дизайну ингибиторов указанных процессов. Развитие этого направления невозможно без совершенствования методов теоретического конформационного анализа углеводов. В представляемом обзоре проводится обобщение литературных данных по возможности применения различных молекулярно-механических силовых полей, методов квантовой механики и молекулярной динамики для изучения конформаций гликозидной связи, а также кратко обсуждается возможность анализировать реакционную способность углеводов с помощью расчетных методов.

Ключевые слова: углеводы, конформационный анализ; молекулярная механика; силовое поле; молекулярная динамика; квантовая механика; ЯМР.

Биоорг. химия 2007, 33(1): 28-43